Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NhsB1AV60 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms