Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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