Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms