Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms