Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms