Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms