Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlhe41Q99PV5 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms