Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrbp1Q99PL5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms