Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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