Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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