Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Olfr754-ps1-201ENSMUST00000173181 911 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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VcanQ62059 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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VcanQ62059 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Prdx5-204ENSMUST00000173091 501 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VcanQ62059 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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