Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC154603.2-201ENSMUST00000223896 577 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms