Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm28047Q3US59 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm28047Q3US59 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gm28047Q3US59 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28047Q3US59 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28047Q3US59 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28047Q3US59 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28047Q3US59 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28047Q3US59 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Gm28047Q3US59 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Gm28047Q3US59 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28047Q3US59 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28047Q3US59 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28047Q3US59 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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