Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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