Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sec31aQ3UPL0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms