Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn10-201ENSMUST00000047761 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms