Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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