Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Nkd1-202ENSMUST00000169179 4081 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Fam124b-201ENSMUST00000058748 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms