Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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