Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Irx1P81068 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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