Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vsnl1P62761 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms