Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Polr2iP60898 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms