Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Rufy4-201ENSMUST00000080167 2306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Zbtb37-201ENSMUST00000159250 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Sem1P60897 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Sem1P60897 Slco1b2-204ENSMUST00000203597 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Parpbp-201ENSMUST00000048518 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Mrpl47-201ENSMUST00000043966 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Kif28-203ENSMUST00000221136 3538 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Sem1P60897 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Sem1P60897 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Sem1P60897 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Sem1P60897 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Sem1P60897 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sem1P60897 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sem1P60897 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Sem1P60897 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Sem1P60897 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sem1P60897 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms