Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csrnp3P59055 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms