Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atp5bP56480 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atp5bP56480 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms