Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms