Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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