Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf13O54965 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf13O54965 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf13O54965 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf13O54965 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf13O54965 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Rnf13O54965 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Rnf13O54965 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf13O54965 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf13O54965 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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