Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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Sp100O35892 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Sp100O35892 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Sp100O35892 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Sp100O35892 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sp100O35892 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
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