Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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