Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms