Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms