Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms