Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tspan4Q9DCK3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms