Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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