Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Use1Q9CQ56 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Use1Q9CQ56 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Use1Q9CQ56 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Use1Q9CQ56 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Use1Q9CQ56 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Use1Q9CQ56 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Use1Q9CQ56 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Use1Q9CQ56 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Use1Q9CQ56 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Use1Q9CQ56 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms