Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Pacsin3Q99JB8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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