Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.9 ms