Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms