Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc63Q8CDV6 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms