Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Amigo3Q8C2S7 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Amigo3Q8C2S7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Amigo3Q8C2S7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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