Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8BGC1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms