Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc50Q810U5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms