Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms