Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ClmQ7TSN2 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms