Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Shq1Q7TMX5 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Shq1Q7TMX5 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Shq1Q7TMX5 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Shq1Q7TMX5 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Shq1Q7TMX5 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Shq1Q7TMX5 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Shq1Q7TMX5 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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