Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Usf2Q64705 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Usf2Q64705 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf2Q64705 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Usf2Q64705 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Usf2Q64705 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf2Q64705 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf2Q64705 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf2Q64705 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf2Q64705 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf2Q64705 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf2Q64705 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf2Q64705 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf2Q64705 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms