Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms