Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdp2Q504M2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms