Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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